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心 树 洞 T o b i n s H o m e 首 页 新 建 文 章 L i n u x 硬 盘 扩 容 最 近 在 玩 O r a n g e P i ， 并 且 给 我 原 来 的 3 2 G 的 系 统 盘 拷 贝 到 了 2 5 6 G 的 硬 盘 上 ， 这 时 候 默 认 启 动 之 后 还 是 使 用 的 是 3 2 G 空 间 。 而 且 就 算 调 用 了 r e s i z e 2 f s 会 告 诉 你 已 经 分 配 全 部 空 间 了 。 参 考 h t t p s 阅 读 更 多 . . . d d 命 令 备 份 坏 块 硬 盘 时 命 令 # d d i f = / d e v / s d e 1 o f = b a c k u p . i m g c o n v = s y n c , n o e r r o r s t a t u s = p r o g r e s s 简 单 做 一 个 记 录 ， 其 中 s y n c 作 用 是 遇 到 坏 块 时 以 0 填 充 ， 保 证 字 节 的 相 阅 读 更 多 . . . W i n d o w s 1 1 利 用 M s y s ( M i n g w 6 4 ) 编 译 R 非 R t o o l s 注 意 注 意 ， 按 照 这 个 方 式 编 译 后 的 R ， 很 多 R c p p 开 头 的 包 都 要 源 码 方 式 重 新 编 译 安 装 ， 否 则 会 出 错 ！ ！ 首 先 ， 我 之 所 以 会 做 这 个 事 情 是 因 为 我 某 次 更 新 w i n 1 1 之 后 ， 发 现 我 的 所 有 R 包 全 都 用 不 了 了 。 于 是 乎 我 更 新 了 R 阅 读 更 多 . . . A N N O V A R 的 天 坑 问 题 现 在 对 于 突 变 结 果 的 注 释 ， 很 多 人 会 采 用 A N N O V A R 进 行 。 但 是 我 最 近 发 现 一 个 A N N O V A R 很 难 发 现 的 一 个 天 坑 问 题 。 一 般 情 况 下 ， 我 们 都 是 直 接 调 用 t a b l e _ a n n o v a r . p l 脚 本 对 v c f 文 件 直 接 进 阅 读 更 多 . . . 绘 制 非 等 高 桑 基 图 很 多 时 候 ， 我 们 会 有 绘 制 非 等 高 桑 基 图 的 需 求 。 本 来 我 这 个 文 章 写 了 一 次 了 ， 结 果 服 务 器 出 问 题 提 交 失 败 了 。 所 以 没 耐 心 再 写 一 次 。 我 就 直 接 贴 代 码 说 明 一 下 代 码 吧 。 l i b r a r y ( g g a l l u v i a l ) l i b r 阅 读 更 多 . . . 主 成 分 分 析 ( P C A ) 从 入 门 到 理 解 网 络 上 有 很 多 关 于 P C A 的 文 章 ， 不 得 不 说 其 实 这 个 概 念 本 身 是 不 难 的 ， 然 后 网 上 就 出 现 了 很 多 各 种 各 样 的 理 解 和 解 读 ， 反 而 加 大 了 大 家 对 于 这 个 概 念 的 理 解 难 度 。 最 近 我 发 现 生 物 信 息 学 之 中 对 于 P C A 的 应 用 挺 常 见 的 ， 但 是 阅 读 更 多 . . . W G C N A 简 单 原 理 记 录 W G C N A ， 全 名 加 权 基 因 网 络 分 析 ， 目 的 是 更 好 的 使 用 基 因 在 样 本 中 的 表 达 量 去 衡 量 基 因 与 基 因 之 间 的 关 系 。 本 文 不 涉 及 W G C N A 的 具 体 实 践 ， 也 不 涉 及 具 体 公 式 推 导 和 证 明 ， 有 需 要 者 可 以 直 接 参 考 R 包 W G C N A 的 教 程 阅 读 更 多 . . . R N A S e q 差 异 表 达 中 标 准 化 方 法 集 合 ( R P K M , F P K M , T P M , D E S e q , e d g e R ) 在 计 算 R N A S e q 流 程 之 中 的 表 达 量 差 异 ， 也 就 是 比 较 不 同 样 本 之 间 的 R N A 测 序 r e a d s 数 的 差 异 （ 因 为 我 们 认 为 表 达 量 大 的 基 因 ， R N A 量 也 会 大 ， 反 转 录 的 c D N A 量 也 会 大 ， 那 么 测 序 的 结 果 这 部 分 的 c D N A 覆 盖 阅 读 更 多 . . . G r e p 正 则 表 达 式 G r e p 可 以 说 是 一 个 非 常 好 用 ， 而 且 经 常 使 用 的 工 具 。 但 是 在 使 用 的 g r e p 的 时 候 ， 经 常 会 遇 到 一 些 问 题 。 最 近 在 进 行 数 据 的 剔 除 ， 所 以 使 用 g r e p 的 正 则 表 达 式 进 行 处 理 。 正 则 表 达 的 规 则 如 下 : ( ) 括 号 中 是 阅 读 更 多 . . . B i o c o n d u c t o r 之 a f f y 中 q u a n t i l e s n o r m a l i z a t i o n ( 分 位 数 标 准 化 ) 方 法 的 介 绍 q u a n t i l e s 标 准 化 ， 也 就 是 我 将 要 介 绍 的 最 后 一 个 标 准 化 方 法 ， 这 个 标 准 化 方 法 显 然 是 顾 名 思 义 就 是 根 据 分 位 数 进 行 标 准 化 。 该 算 法 在 B i o c o n d u c t o r 包 内 的 p r e p r o c e s s C o r e 包 内 ， 并 且 是 由 阅 读 更 多 . . . 上 一 页 1 2 3 下 一 页 搜 索 搜 索 作 者 微 信 号 作 者 邮 箱 二 维 码 最 新 文 章 L i n u x 硬 盘 扩 容 d d 命 令 备 份 坏 块 硬 盘 时 命 令 W i n d o w s 1 1 利 用 M s y s ( M i n g w 6 4 ) 编 译 R 非 R t o o l s A N N O V A R 的 天 坑 问 题 绘 制 非 等 高 桑 基 图 主 成 分 分 析 ( P C A ) 从 入 门 到 理 解 W G C N A 简 单 原 理 记 录 R N A S e q 差 异 表 达 中 标 准 化 方 法 集 合 ( R P K M , F P K M , T P M , D E S e q , e d g e R ) G r e p 正 则 表 达 式 B i o c o n d u c t o r 之 a f f y 中 q u a n t i l e s n o r m a l i z a t i o n ( 分 位 数 标 准 化 ) 方 法 的 介 绍 热 门 标 签 A N N O V A R P C A R C M a k e J a v a t a r L i n u x 本 设 计 由 简 . 工 作 室 荣 誉 出 品 c o p y r i g h t @ 2 0 1 8 ~ 2 0 2 0 J P r e s s （ w w w . j p r e s s . i o ） 浙 I C P 备 1 6 0 4 5 8 8 5 号 浙 公 网 安 备 3 3 0 3 9 9 0 2 0 0 0 2 4 1 为 避 免 版 权 问 题 ， 公 开 了 源 码

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